Audi A6 Avant будет предлагаться с тремя мощными двигателями на выбор – бензиновым и двумя дизельными. Бензиновый двигатель – четырёхцилиндровый 40 TFSI объёмом 2,0 л, мощностью 190 л. с. разгоняет автомобиль до 100 км/ч за 8,1 с. Дизель 40 TDI такой же мощности, также четырёхцилиндровый, обладает крутящим моментом 400 Нм, разгоняет автомобиль до 100 км/ч за 8,6 с и расходует в среднем 5,3–5,5 л топлива на 100 км пути. На вершине модельного ряда – модификация 45 TDI с двигателем V6 объёмом 3,0 л, мощностью 249 л. с. и крутящим моментом 600 Нм.